Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NfkbieO54910 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NfkbieO54910 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms