Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200O54901 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd200O54901 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd200O54901 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd200O54901 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd200O54901 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd200O54901 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd200O54901 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd200O54901 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cd200O54901 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd200O54901 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd200O54901 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd200O54901 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd200O54901 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd200O54901 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd200O54901 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd200O54901 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd200O54901 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd200O54901 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd200O54901 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd200O54901 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd200O54901 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd200O54901 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms