Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itgb3O54890 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb3O54890 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms