Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Srpk2O54781 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Srpk2O54781 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Srpk2O54781 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms