Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab33bO35963 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms