Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3cdO35904 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3cdO35904 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3cdO35904 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3cdO35904 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3cdO35904 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3cdO35904 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pik3cdO35904 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Pik3cdO35904 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pik3cdO35904 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pik3cdO35904 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms