Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf12O35738 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf12O35738 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf12O35738 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf12O35738 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf12O35738 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms