Protein–RNA interactions for Protein: O35643

Ap1b1, AP-1 complex subunit beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1b1O35643 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap1b1O35643 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ap1b1O35643 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap1b1O35643 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms