Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc1a6O35544 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc1a6O35544 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms