Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms