Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppef2O35385 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppef2O35385 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppef2O35385 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppef2O35385 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppef2O35385 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppef2O35385 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppef2O35385 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms