Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Abcc1O35379 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Abcc1O35379 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Abcc1O35379 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc1O35379 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms