Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih1O35372 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Cnih1O35372 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Cnih1O35372 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cnih1O35372 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cnih1O35372 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih1O35372 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Cnih1O35372 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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