Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptpn9O35239 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn9O35239 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn9O35239 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn9O35239 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn9O35239 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn9O35239 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn9O35239 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms