Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bhlhe40O35185 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bhlhe40O35185 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms