Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casq1O09165 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casq1O09165 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casq1O09165 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casq1O09165 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casq1O09165 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casq1O09165 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Casq1O09165 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Casq1O09165 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casq1O09165 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casq1O09165 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms