Protein–RNA interactions for Protein: O08790

Fpr-s1, Formyl peptide receptor-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fpr-s1O08790 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fpr-s1O08790 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Fpr-s1O08790 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fpr-s1O08790 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fpr-s1O08790 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Fpr-s1O08790 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fpr-s1O08790 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fpr-s1O08790 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fpr-s1O08790 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fpr-s1O08790 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fpr-s1O08790 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fpr-s1O08790 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fpr-s1O08790 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Fpr-s1O08790 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Fpr-s1O08790 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fpr-s1O08790 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fpr-s1O08790 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms