Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3aO08759 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3aO08759 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3aO08759 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3aO08759 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3aO08759 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3aO08759 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3aO08759 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3aO08759 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3aO08759 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3aO08759 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3aO08759 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3aO08759 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ube3aO08759 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms