Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barx2O08686 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barx2O08686 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barx2O08686 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barx2O08686 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Barx2O08686 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Barx2O08686 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Barx2O08686 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Barx2O08686 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Barx2O08686 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Barx2O08686 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms