Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn2O08529 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn2O08529 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn2O08529 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn2O08529 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn2O08529 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn2O08529 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn2O08529 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn2O08529 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn2O08529 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn2O08529 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn2O08529 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn2O08529 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn2O08529 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn2O08529 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn2O08529 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn2O08529 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn2O08529 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms