Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp35M0QWN7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
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Usp35M0QWN7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Usp35M0QWN7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Usp35M0QWN7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Usp35M0QWN7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp35M0QWN7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp35M0QWN7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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