Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ascl4M0QW46 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ascl4M0QW46 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ascl4M0QW46 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms