Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E2

Gm8271, Predicted gene 8271, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8271L7N2E2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm8271L7N2E2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm8271L7N2E2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm8271L7N2E2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm8271L7N2E2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm8271L7N2E2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm8271L7N2E2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm8271L7N2E2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm8271L7N2E2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm8271L7N2E2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm8271L7N2E2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm8271L7N2E2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm8271L7N2E2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm8271L7N2E2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm8271L7N2E2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm8271L7N2E2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm8271L7N2E2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm8271L7N2E2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm8271L7N2E2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm8271L7N2E2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm8271L7N2E2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm8271L7N2E2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm8271L7N2E2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms