Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm20878L7N244 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20878L7N244 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20878L7N244 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms