Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20939L7N243 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20939L7N243 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms