Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3542K7N6U2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3542K7N6U2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3542K7N6U2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3542K7N6U2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3542K7N6U2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3542K7N6U2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3542K7N6U2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms