Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm21887J3QQ04 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm21887J3QQ04 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms