Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8298J3QPI0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8298J3QPI0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms