Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm933J3QPC1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm933J3QPC1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm933J3QPC1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm933J3QPC1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm933J3QPC1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm933J3QPC1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm933J3QPC1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm933J3QPC1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm933J3QPC1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm933J3QPC1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm933J3QPC1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm933J3QPC1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm933J3QPC1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm933J3QPC1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm933J3QPC1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm933J3QPC1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm933J3QPC1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm933J3QPC1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm933J3QPC1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm933J3QPC1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm933J3QPC1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms