Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim18J3QNP2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim18J3QNP2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms