Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34c2J3QNM1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34c2J3QNM1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c2J3QNM1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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