Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20830J3KML6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms