Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp408H7BX78 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp408H7BX78 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp408H7BX78 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164 ms