Protein–RNA interactions for Protein: H3BJG9

Ly6l, Lymphocyte antigen 6L, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6lH3BJG9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6lH3BJG9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6lH3BJG9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6lH3BJG9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6lH3BJG9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6lH3BJG9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6lH3BJG9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6lH3BJG9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6lH3BJG9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6lH3BJG9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6lH3BJG9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6lH3BJG9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6lH3BJG9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6lH3BJG9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6lH3BJG9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6lH3BJG9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6lH3BJG9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ly6lH3BJG9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6lH3BJG9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms