Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf4bG5E8Z2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf4bG5E8Z2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf4bG5E8Z2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.2 ms