Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
HrcG5E8J6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HrcG5E8J6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HrcG5E8J6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HrcG5E8J6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HrcG5E8J6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HrcG5E8J6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HrcG5E8J6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HrcG5E8J6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HrcG5E8J6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HrcG5E8J6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HrcG5E8J6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HrcG5E8J6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HrcG5E8J6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HrcG5E8J6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HrcG5E8J6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HrcG5E8J6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HrcG5E8J6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HrcG5E8J6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms