Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2b1G5E829 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b1G5E829 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b1G5E829 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms