Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pnmal2G3X9N3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pnmal2G3X9N3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pnmal2G3X9N3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pnmal2G3X9N3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pnmal2G3X9N3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pnmal2G3X9N3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pnmal2G3X9N3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pnmal2G3X9N3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pnmal2G3X9N3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pnmal2G3X9N3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Pnmal2G3X9N3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pnmal2G3X9N3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pnmal2G3X9N3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms