Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zkscan2G3X952 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms