Protein–RNA interactions for Protein: F8VQK7

Gm16519, Predicted gene, 16519, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16519F8VQK7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm16519F8VQK7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms