Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4aF8VPX6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Speer4aF8VPX6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Speer4aF8VPX6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms