Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp9yF8VPU6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms