Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arid4aF8VPQ2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arid4aF8VPQ2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arid4aF8VPQ2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Arid4aF8VPQ2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arid4aF8VPQ2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arid4aF8VPQ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arid4aF8VPQ2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arid4aF8VPQ2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arid4aF8VPQ2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arid4aF8VPQ2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arid4aF8VPQ2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arid4aF8VPQ2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Arid4aF8VPQ2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arid4aF8VPQ2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms