Protein–RNA interactions for Protein: F7CD45

Gm8334, Predicted gene 8334, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8334F7CD45 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8334F7CD45 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8334F7CD45 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms