Protein–RNA interactions for Protein: F7BE40

Arl9, ADP-ribosylation factor-like 9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl9F7BE40 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl9F7BE40 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arl9F7BE40 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arl9F7BE40 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms