Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm28038F7BCN9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gm28038F7BCN9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm28038F7BCN9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm28038F7BCN9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm28038F7BCN9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28038F7BCN9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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