Protein–RNA interactions for Protein: F7AXR3

Gm17654, Predicted gene, 17654 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17654F7AXR3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17654F7AXR3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17654F7AXR3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms