Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Crocc2F6XLV1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Crocc2F6XLV1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Crocc2F6XLV1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Crocc2F6XLV1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Crocc2F6XLV1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms