Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp988F6VKC7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp988F6VKC7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms