Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28305F6U473 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28305F6U473 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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